تطوير نظام خبير للكشف المبكر لسرطان القولون.. باحثان في جامعة دمشق لـ “داما بوست”: يستخدم خوارزميات التعلم العميق
داما بوست- منهل إبراهيم| شرح كل من أ. د. م. رشا مسعود، و د. م. عدنان اسبر من قسم الهندسة الطبية في كلية الهندسة الميكانيكية والكهربائية بجامعة دمشق لـ داما بوست عن “تطوير نظام خبير للكشف المبكر لسرطان القولون” بالقول إن هذا البحث هو نظام خبير للكشف المبكر عن سرطان القولون والمستقيم باستخدام خوارزميات التعلم العميق وذلك بالاعتماد على تقدير كمية (RNA) المتضاعف المشفر وغير المشفر عن طريق قياس التعبير الجيني لـ بروتين C-FLIP كميا في الخلية عن طريق تحري عند المنتجات transcripts، وهذا النظام عبارة عن تطبيق قائم على التعلم العميق وهذا النظام مخصص لاستقبال صور من RT-PCR وتحليلها من أجل تشخيص وتحديد سرطان القولون.
وأوضحا أنه في هذا البحث تم بناء برنامج خبير يتم إدخال إليه صور (qPCR ) المأخوذة المنحنى تضاعف مورثة بروتين – C . Flip للحصول على نتائج تعيد بوجود أو بعدم وجود سرطان القولون، حيث تم بناء البرنامج بلغة بايثون / يتضمن مكتبات التعلم العميق Tensorflow, scikit-lean / keras .
وأضافا “يقوم البرنامج باستقبال الصورة وقراءة قيم الـ Ct للمنحنيات الثلاثة ويمكن ادخال قيم الـ Ct يدويا وبعدها تظهر ايقونة التشخيص ويشخص النظام الحالة طبيعية أو مريض ويحدد البرنامج درجة الورم استناداً لقيم التعبير الجيني.
وأشار الباحثان إلى أن خلاصة الفكرة، هي فكرة برنامج ذو واجهة تفاعلية يقوم بحساب التعبير الجيني( قيم الـCt) لأي جين عن طريق إدخال صور المنحنى البياني من جهاز (qPCR ) دون إجراء أي حسابات رياضية.
وأوضح الباحثان أنه برنامج يستخدم التعلم العميق الشبكة العصبونية الالتفافية أو GANS)، حيث يتم ادخال صور ناتجة عن (qPCR ) ويكون خرج هذا البرنامج تحديد فيما اذا كان ورم القولون خبيث أم حميد.
وختم الباحثان في جامعة دمشق بالقول إن البرنامج يحدد درجة الورم استناداً إلى صور المنحنى البياني من جهاز (qPCR )، والبرنامج يمكن أن يصبح تطبيقاً على الهاتف المحمول.
وكان الدكتور عدنان اسبر من قسم الهندسة الطبية في كلية الهندسة الميكانيكية والكهربائية بجامعة دمشق قدم بحثاً تضمن تطوير نظام تنبؤي خبير بسرطان القولون باستخدام الذكاء الصنعي، طرح فيه استخدام طرق الذكاء الصنعي والتعلم العميق لتحديد درجة المرض والكشف المبكر من خلال الواسمات الحيوية.
والبحث قدمه الدكتور اسبر في أعمال المؤتمر الطبي الثالث حول الوراثة الجزيئية وتطبيقاتها السريرية، والذي أقامته هيئة التميز والإبداع وجامعة دمشق بالتعاون مع الرابطة السورية لعلم الأمراض والجمعية السورية للمولدين والنسائيين.